RxDock 0.1.0
A fast, versatile, and open-source program for docking ligands to proteins and nucleic acids
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rxdock::SimAnnTransform Member List

This is the complete list of members for rxdock::SimAnnTransform, including all inherited members.

_BLOCK_LENGTH (defined in rxdock::SimAnnTransform)rxdock::SimAnnTransformstatic
_CLASS (defined in rxdock::BaseObject)rxdock::BaseObjectstatic
_CT (defined in rxdock::SimAnnTransform)rxdock::SimAnnTransformstatic
_ENABLED (defined in rxdock::BaseObject)rxdock::BaseObjectstatic
_FINAL_T (defined in rxdock::SimAnnTransform)rxdock::SimAnnTransformstatic
_HISTORY_FREQ (defined in rxdock::SimAnnTransform)rxdock::SimAnnTransformstatic
_MIN_ACC_RATE (defined in rxdock::SimAnnTransform)rxdock::SimAnnTransformstatic
_NAME (defined in rxdock::BaseObject)rxdock::BaseObjectstatic
_NUM_BLOCKS (defined in rxdock::SimAnnTransform)rxdock::SimAnnTransformstatic
_PARTITION_DIST (defined in rxdock::SimAnnTransform)rxdock::SimAnnTransformstatic
_PARTITION_FREQ (defined in rxdock::SimAnnTransform)rxdock::SimAnnTransformstatic
_SCALE_CHROM_LENGTH (defined in rxdock::SimAnnTransform)rxdock::SimAnnTransformstatic
_START_T (defined in rxdock::SimAnnTransform)rxdock::SimAnnTransformstatic
_STEP_SIZE (defined in rxdock::SimAnnTransform)rxdock::SimAnnTransformstatic
Add(BaseTransform *) (defined in rxdock::BaseTransform)rxdock::BaseTransformvirtual
AddParameter(const std::string &strName, const Variant &vValue) (defined in rxdock::ParamHandler)rxdock::ParamHandlerprotected
AddSFRequest(RequestPtr) (defined in rxdock::BaseTransform)rxdock::BaseTransform
BaseBiMolTransform(const std::string &strClass, const std::string &strName) (defined in rxdock::BaseBiMolTransform)rxdock::BaseBiMolTransformprotected
BaseObject(const std::string &strClass, const std::string &strName) (defined in rxdock::BaseObject)rxdock::BaseObjectprotected
BaseObject() (defined in rxdock::BaseObject)rxdock::BaseObjectprotected
BaseTransform(const std::string &strClass, const std::string &strName) (defined in rxdock::BaseTransform)rxdock::BaseTransformprotected
ClearParameters() (defined in rxdock::ParamHandler)rxdock::ParamHandlerprotected
ClearSFRequests() (defined in rxdock::BaseTransform)rxdock::BaseTransform
Deleted(Subject *theDeletedSubject) (defined in rxdock::BaseObject)rxdock::BaseObjectvirtual
DeleteParameter(const std::string &strName) (defined in rxdock::ParamHandler)rxdock::ParamHandlerprotected
Disable() (defined in rxdock::BaseObject)rxdock::BaseObject
Enable() (defined in rxdock::BaseObject)rxdock::BaseObject
Execute() (defined in rxdock::SimAnnTransform)rxdock::SimAnnTransformprotectedvirtual
from_json (defined in rxdock::SimAnnTransform)rxdock::SimAnnTransformfriend
GetBlockLength() (defined in rxdock::SimAnnTransform)rxdock::SimAnnTransformstatic
GetClass() const (defined in rxdock::BaseObject)rxdock::BaseObject
GetFinalT() (defined in rxdock::SimAnnTransform)rxdock::SimAnnTransformstatic
GetFullName() const (defined in rxdock::BaseTransform)rxdock::BaseTransformvirtual
GetLigand() const (defined in rxdock::BaseBiMolTransform)rxdock::BaseBiMolTransform
GetName() const (defined in rxdock::BaseObject)rxdock::BaseObject
GetNumBlocks() (defined in rxdock::SimAnnTransform)rxdock::SimAnnTransformstatic
GetNumParameters() const (defined in rxdock::ParamHandler)rxdock::ParamHandler
GetNumTransforms() const (defined in rxdock::BaseTransform)rxdock::BaseTransformvirtual
GetParameter(const std::string &strName) const (defined in rxdock::ParamHandler)rxdock::ParamHandler
GetParameterNames() const (defined in rxdock::ParamHandler)rxdock::ParamHandler
GetParameters() const (defined in rxdock::ParamHandler)rxdock::ParamHandler
GetParentTransform() const (defined in rxdock::BaseTransform)rxdock::BaseTransform
GetPartitionDist() (defined in rxdock::SimAnnTransform)rxdock::SimAnnTransformstatic
GetPartitionFreq() (defined in rxdock::SimAnnTransform)rxdock::SimAnnTransformstatic
GetReceptor() const (defined in rxdock::BaseBiMolTransform)rxdock::BaseBiMolTransform
GetSolvent() const (defined in rxdock::BaseBiMolTransform)rxdock::BaseBiMolTransform
GetStartT() (defined in rxdock::SimAnnTransform)rxdock::SimAnnTransformstatic
GetStepSize() (defined in rxdock::SimAnnTransform)rxdock::SimAnnTransformstatic
GetTransform(unsigned int) const (defined in rxdock::BaseTransform)rxdock::BaseTransformvirtual
GetWorkSpace() const (defined in rxdock::BaseObject)rxdock::BaseObject
Go() (defined in rxdock::BaseTransform)rxdock::BaseTransform
HandleRequest(RequestPtr spRequest) (defined in rxdock::BaseObject)rxdock::BaseObjectvirtual
isAgg() const (defined in rxdock::BaseTransform)rxdock::BaseTransformvirtual
isEnabled() const (defined in rxdock::BaseObject)rxdock::BaseObject
isParameterValid(const std::string &strName) const (defined in rxdock::ParamHandler)rxdock::ParamHandler
MC(double t, int blockLen, double stepSize) (defined in rxdock::SimAnnTransform)rxdock::SimAnnTransformprotected
Observer() (defined in rxdock::Observer)rxdock::Observerprotected
Orphan() (defined in rxdock::BaseTransform)rxdock::BaseTransform
ParameterUpdated(const std::string &strName) (defined in rxdock::BaseObject)rxdock::BaseObjectprotectedvirtual
ParamHandler() (defined in rxdock::ParamHandler)rxdock::ParamHandlerprotected
Print(std::ostream &s) const (defined in rxdock::BaseObject)rxdock::BaseObjectvirtual
Register(WorkSpace *) (defined in rxdock::BaseObject)rxdock::BaseObjectvirtual
Remove(BaseTransform *) (defined in rxdock::BaseTransform)rxdock::BaseTransformvirtual
RequestHandler() (defined in rxdock::RequestHandler)rxdock::RequestHandlerinline
SendSFRequests() (defined in rxdock::BaseTransform)rxdock::BaseTransform
SetName(const std::string &) (defined in rxdock::BaseObject)rxdock::BaseObject
SetParameter(const std::string &strName, const Variant &vValue) (defined in rxdock::ParamHandler)rxdock::ParamHandler
SetupLigand() (defined in rxdock::SimAnnTransform)rxdock::SimAnnTransformprotectedvirtual
SetupReceptor() (defined in rxdock::SimAnnTransform)rxdock::SimAnnTransformprotectedvirtual
SetupSolvent() (defined in rxdock::BaseBiMolTransform)rxdock::BaseBiMolTransforminlineprotectedvirtual
SetupTransform() (defined in rxdock::SimAnnTransform)rxdock::SimAnnTransformprotectedvirtual
SimAnnTransform(const std::string &strName="SIMANN") (defined in rxdock::SimAnnTransform)rxdock::SimAnnTransform
to_json (defined in rxdock::SimAnnTransform)rxdock::SimAnnTransformfriend
Unregister() (defined in rxdock::BaseObject)rxdock::BaseObjectvirtual
Update(Subject *theChangedSubject) (defined in rxdock::BaseBiMolTransform)rxdock::BaseBiMolTransformvirtual
~BaseBiMolTransform() (defined in rxdock::BaseBiMolTransform)rxdock::BaseBiMolTransformvirtual
~BaseObject() (defined in rxdock::BaseObject)rxdock::BaseObjectvirtual
~BaseTransform() (defined in rxdock::BaseTransform)rxdock::BaseTransformvirtual
~Observer() (defined in rxdock::Observer)rxdock::Observervirtual
~ParamHandler() (defined in rxdock::ParamHandler)rxdock::ParamHandlervirtual
~RequestHandler() (defined in rxdock::RequestHandler)rxdock::RequestHandlerinlinevirtual
~SimAnnTransform() (defined in rxdock::SimAnnTransform)rxdock::SimAnnTransformvirtual